Название происходит от бурятского слова хоймор, что означает «северная сторона» («хойто» — «северный»). В частности, северная или задняя (гостевая) сторона юрты. Это слово имеет оттенок уюта. Неслучайно так назвали озёра, расположенные в глубине Тункинской долины.